序號(hào)

更正前

更正后

1

第1項(xiàng)“大熊貓血液全基因組甲基化分析”

服務(wù)要求由“采用高通量測(cè)序技術(shù)；測(cè)序深度：6G”

更正為“采用高通量測(cè)序技術(shù)；測(cè)序深度：**G”

2

第2項(xiàng)“大熊貓糞便宏基因組學(xué)檢測(cè)”

服務(wù)要求由“采用高通量測(cè)序技術(shù)；測(cè)序深度：6G”

更正為“根據(jù)采購(gòu)人提供的動(dòng)物糞便樣品進(jìn)行DNA提取，構(gòu)建文庫(kù)（文庫(kù)有效濃度＞3nM），采用高通量測(cè)序技術(shù)；測(cè)序深度：6G；數(shù)據(jù)分析流程包括：1)數(shù)據(jù)質(zhì)控；2)Metagenome組裝；3)基因預(yù)測(cè)；4)物種注釋；5)進(jìn)行代謝通路（KEGG），碳水化合物酶（CAZy）的功能注釋和豐度分析；6)基于物種豐度表和功能豐度表，可以進(jìn)行豐度聚類分析，PCA和NMDS降維分析，Adonis和ANOSIM分析，樣品聚類分析；7)抗性基因注釋，獲得抗性基因豐度分布情況以及這些抗性基因的物種歸屬和與大熊貓揮發(fā)性信外激素形成的抗性機(jī)制?！?

3

第3項(xiàng)“大熊貓樣品轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)”

服務(wù)要求由“根據(jù)采購(gòu)人提供的樣品進(jìn)行RNA提取，進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)分析，Q** ≥**%。文庫(kù)類型：普通轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)；測(cè)序策略：PE**0，測(cè)序數(shù)據(jù)量（Clean data）：6G，分析內(nèi)容：可變剪切分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)、SNP/InDel分析、基因表達(dá)水平分析、樣本間基因表達(dá)水平的相關(guān)性分析、基因差異表達(dá)分析、差異表達(dá)基因的GO及KEGG富集分析、差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析、差異表達(dá)基因中的轉(zhuǎn)錄因子鑒定。”

更正為

“根據(jù)采購(gòu)人提供的樣品進(jìn)行RNA提取，進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)分析，Q** ≥**%。文庫(kù)類型：普通轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)；測(cè)序策略：PE**0，測(cè)序數(shù)據(jù)量（Clean data）：6G，分析內(nèi)容：可變剪切分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)、基因表達(dá)水平分析、樣本間基因表達(dá)水平的相關(guān)性分析、基因差異表達(dá)分析、差異表達(dá)基因的GO及KEGG富集分析、差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析、差異表達(dá)基因中的轉(zhuǎn)錄因子鑒定?！?

4

第5項(xiàng)“尿液、糞便和血液短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸及游離脂肪酸檢測(cè)”

服務(wù)名稱由“尿液、糞便和血液短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸及游離脂肪酸檢測(cè)”

服務(wù)要求由“根據(jù)采購(gòu)人提供的樣品進(jìn)行檢測(cè)，對(duì)短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸、游離脂肪酸的定性和絕對(duì)定量分析。檢測(cè)模式：scan模式或sim模式；檢測(cè)精度：≤0.1 mg/L；線性：R2≥0.**；精密度：RSD≤**%。

1.需包括針對(duì)不同脂肪酸進(jìn)行開(kāi)發(fā)的kit，能夠同時(shí)對(duì)短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸和游離脂肪酸進(jìn)行絕對(duì)定量分析,使用GC- MS/MS。

2.利用QC質(zhì)控樣本對(duì)檢測(cè)過(guò)程中的儀器狀態(tài)進(jìn)行監(jiān)控和脂肪酸標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)保留時(shí)間進(jìn)行校正，對(duì)定量結(jié)果的可靠性進(jìn)行多重保障。

3.運(yùn)用內(nèi)標(biāo)法并進(jìn)行絕對(duì)定量，保證有效消除基質(zhì)效應(yīng)，提高定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。

4.常規(guī)實(shí)驗(yàn)描述：包括實(shí)驗(yàn)名稱、報(bào)告時(shí)間、樣品基本信息、實(shí)驗(yàn)原理、實(shí)驗(yàn)儀器、實(shí)驗(yàn)方法描述和實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

5.圖譜：標(biāo)準(zhǔn)品TIC圖譜，每組樣本其中一個(gè)樣本的TIC圖譜。

6.方法學(xué)和標(biāo)準(zhǔn)曲線：提供LOQ，線性范圍，線性公式。

7.生物學(xué)樣本中代謝物檢測(cè)數(shù)據(jù)及圖譜：代謝物的保留時(shí)間（RT）和定量離子（m/z），色譜峰面積（原始強(qiáng)度值），根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算得到的代謝物濃度值，兩組樣本比較的比值，ttest p 值。”

服務(wù)名稱更正為“尿液、糞便和血液短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸檢測(cè)”

服務(wù)要求更正為

“根據(jù)采購(gòu)人提供的樣品進(jìn)行檢測(cè)，對(duì)短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸的定性和絕對(duì)定量分析。檢測(cè)模式：scan模式或sim模式；檢測(cè)精度：≤0.1 mg/L；線性：R2≥0.**；精密度：RSD≤**%。

1.需包括針對(duì)不同脂肪酸進(jìn)行開(kāi)發(fā)的kit，能夠同時(shí)對(duì)短鏈脂肪酸、中長(zhǎng)鏈脂肪酸進(jìn)行絕對(duì)定量分析。

2.利用QC質(zhì)控樣本對(duì)檢測(cè)過(guò)程中的儀器狀態(tài)進(jìn)行監(jiān)控和脂肪酸標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)保留時(shí)間進(jìn)行校正，對(duì)定量結(jié)果的可靠性進(jìn)行多重保障。

3.運(yùn)用內(nèi)標(biāo)法并進(jìn)行絕對(duì)定量，保證有效消除基質(zhì)效應(yīng)，提高定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。

4.常規(guī)實(shí)驗(yàn)描述：包括實(shí)驗(yàn)名稱、報(bào)告時(shí)間、樣品基本信息、實(shí)驗(yàn)原理、實(shí)驗(yàn)儀器、實(shí)驗(yàn)方法描述和實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

5.標(biāo)準(zhǔn)品提取離子流色譜圖。

6.方法學(xué)和標(biāo)準(zhǔn)曲線：提供LOQ，線性范圍，線性公式。

7.生物學(xué)樣本中代謝物檢測(cè)數(shù)據(jù)及圖譜：代謝物的保留時(shí)間（RT）和定量離子（m/z），色譜峰面積（原始強(qiáng)度值），根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算得到的代謝物濃度值，兩組樣本比較的比值，ttest p 值。”

5

第6項(xiàng)“血液、尿液和糞便靶向代謝測(cè)定（至少包括脂質(zhì)組、膽汁酸、花生四烯酸等）”

服務(wù)名稱由“血液、尿液和糞便靶向代謝測(cè)定（至少包括脂質(zhì)組、膽汁酸、花生四烯酸等）”

服務(wù)要求由“1.專門針對(duì)各靶向代謝物進(jìn)行開(kāi)發(fā)的kit，脂質(zhì)代謝物數(shù)量****+，能夠至少同時(shí)對(duì)各種靶向代謝物進(jìn)行絕對(duì)定量分析。

2.利用QC質(zhì)控樣本對(duì)檢測(cè)過(guò)程中的儀器狀態(tài)進(jìn)行監(jiān)控和靶向代謝物標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)保留時(shí)間進(jìn)行校正，對(duì)定量結(jié)果的可靠性進(jìn)行多重保障。

3.運(yùn)用同位素內(nèi)標(biāo)法并進(jìn)行絕對(duì)定量，同位素內(nèi)標(biāo)**+，保證有效消除基質(zhì)效應(yīng)，提高定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。

4.常規(guī)實(shí)驗(yàn)描述：包括實(shí)驗(yàn)名稱、報(bào)告時(shí)間、樣品基本信息、實(shí)驗(yàn)原理、實(shí)驗(yàn)儀器、實(shí)驗(yàn)方法描述和實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析結(jié)論。

5.系統(tǒng)穩(wěn)定性數(shù)據(jù)及圖譜：代謝物的MRM方法參數(shù)（Q1和Q3），QC樣本的保留時(shí)間，色譜峰面積，面積相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差（RSD），標(biāo)準(zhǔn)品XIC圖譜。

6.生物學(xué)樣本中代謝物檢測(cè)數(shù)據(jù)及圖譜：至少包括保留時(shí)間，色譜峰面積（原始強(qiáng)度值），兩組樣本較的比值，test p 值；聚類熱圖，變化趨勢(shì)圖（折線圖或者箱線圖），脂質(zhì)類別分析，鏈長(zhǎng)度，鏈飽和度分析等?！?

服務(wù)名稱更正為“血液、尿液和糞便靶向代謝測(cè)定（至少包括膽汁酸、花生四烯酸等）”

服務(wù)要求更正為

“1.專門針對(duì)各靶向代謝物進(jìn)行開(kāi)發(fā)的kit，能夠至少同時(shí)對(duì)各種靶向代謝物進(jìn)行絕對(duì)定量分析。

2.利用QC質(zhì)控樣本對(duì)檢測(cè)過(guò)程中的儀器狀態(tài)進(jìn)行監(jiān)控和靶向代謝物標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)保留時(shí)間進(jìn)行校正，對(duì)定量結(jié)果的可靠性進(jìn)行多重保障。

3.運(yùn)用同位素內(nèi)標(biāo)法并進(jìn)行絕對(duì)定量，同位素內(nèi)標(biāo)**+，保證有效消除基質(zhì)效應(yīng)，提高定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。

4.常規(guī)實(shí)驗(yàn)描述：包括實(shí)驗(yàn)名稱、報(bào)告時(shí)間、樣品基本信息、實(shí)驗(yàn)原理、實(shí)驗(yàn)儀器、實(shí)驗(yàn)方法描述和實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析結(jié)論。

5.系統(tǒng)穩(wěn)定性數(shù)據(jù)及圖譜：代謝物的MRM方法參數(shù)（Q1和Q3），QC樣本的保留時(shí)間，色譜峰面積，面積相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差（RSD），標(biāo)準(zhǔn)品XIC圖譜。

6.生物學(xué)樣本中代謝物檢測(cè)數(shù)據(jù)及圖譜：至少包括保留時(shí)間，色譜峰面積（原始強(qiáng)度值），兩組樣本較的比值，test p 值；聚類熱圖，變化趨勢(shì)圖（折線圖或者箱線圖）等。”

6

第**項(xiàng)“大熊貓組織樣品庫(kù)平臺(tái)搭建”

服務(wù)要求由“Hi-C文庫(kù)構(gòu)建測(cè)序；每個(gè)個(gè)體不低于**0G（**×）的數(shù)據(jù)量；利用juicer軟件運(yùn)行后的有效利用率不低于**%；遠(yuǎn)距離互作（≥**Kb）的比例不低于**%?！?

更正為

“Hi-C文庫(kù)構(gòu)建測(cè)序；每個(gè)個(gè)體不低于**0G（**×）的數(shù)據(jù)量；數(shù)據(jù)有效利用率不低于**%；遠(yuǎn)距離互作（≥**Kb）的比例不低于**%。”

7

第**項(xiàng)“宏基因組學(xué)檢測(cè)”

服務(wù)要求由“1.儀器設(shè)備平臺(tái)要求：

供應(yīng)商需要自行準(zhǔn)備的儀器至少包括Agilent生物分析儀、PCR儀、Illumina Novaseq XPlus測(cè)序平臺(tái)，DNBSEQ-T7測(cè)序平臺(tái)，并能同步開(kāi)展多組學(xué)項(xiàng)目。

2.技術(shù)要求：

1) DNA質(zhì)量合格。建議起始量：0.2μg；最低起始量：0.1μg

2) 主帶清晰。如DNA降解嚴(yán)重但是降解片段集中于****bp以上（包括本數(shù)），經(jīng)采購(gòu)人同意可進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)建庫(kù)

3) 濃度：> ** ng/μL

3.數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量和數(shù)量要求：

1) 所有樣本平均產(chǎn)出≥最終規(guī)格

2）數(shù)據(jù)質(zhì)量Q**>**%，Q**>**％

3) N**≥****

4.檢測(cè)周期：

收到樣品后不超過(guò)**個(gè)自然日

5.結(jié)果交付：

1）分析結(jié)果包含

1.1 數(shù)據(jù)質(zhì)控統(tǒng)計(jì)表

1.2 有效數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

1.3 Alpha多樣性分析，Beta多樣性分析，物種注釋與優(yōu)勢(shì)菌展示，物種差異分析”

更正為

“對(duì)采購(gòu)人提供的多個(gè)物種的糞便、組織、水源等樣本進(jìn)行分析。
1、儀器設(shè)備平臺(tái)：
供應(yīng)商需要自行準(zhǔn)備的儀器至少包括生物分析儀、PCR儀、二代或三代測(cè)序平臺(tái)，并能同步開(kāi)展多組學(xué)項(xiàng)目。
2、質(zhì)檢合格要求：
1)DNA質(zhì)量合格，總量滿足要求。建議起始量：0.2μg；最低起始量：0.1μg
2)主帶清晰。如DNA降解嚴(yán)重但是降解片段集中于****bp以上，經(jīng)客戶同意可進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)建庫(kù)
3)濃度：>**ng/μL
3、數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量和數(shù)量要求：
1)所有樣本平均產(chǎn)出≥最終規(guī)格
2）數(shù)據(jù)質(zhì)量Q**>**%，Q**>**％
3)N**≥****
4、檢測(cè)周期：
收到樣**個(gè)自然日
5、結(jié)果交付：
1）標(biāo)準(zhǔn)分析結(jié)果包含
1.1數(shù)據(jù)質(zhì)控統(tǒng)計(jì)表
1.2有效數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
1.3Alpha多樣性分析，Beta多樣性分析，物種注釋與優(yōu)勢(shì)菌展示，毒力基因注釋，物種差異分析，微生物種群結(jié)構(gòu)分析?！?

8

第**項(xiàng)“非靶向蛋白組（含高豐度蛋白檢測(cè)）”的服務(wù)要求更正為：“針對(duì)樣本進(jìn)行相對(duì)定量（常規(guī)+全掃描），常規(guī)非靶向定量分析使用液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS/MS)技術(shù)，基于鳥(niǎo)槍法（shotgun）的數(shù)據(jù)采集方式。全掃描定量分析采用DIA（data-independent acquisition）技術(shù)(包括預(yù)實(shí)驗(yàn)評(píng)估和自建庫(kù))。質(zhì)譜性能要求如下：儀器參數(shù)：全掃描MS：**0fg 上柱量利血平的S/N為**0：1、SIM：** fg 上柱量利血平的S/N為**0：1，分辨率為**0,**0 @ m/z **0，掃描速度為** Hz；分析平臺(tái)（常規(guī)）：用軟件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4進(jìn)行查庫(kù)鑒定及定量分析；分析平臺(tái)（全掃描）：Proteome Discoverer 2.2進(jìn)行搜庫(kù)，數(shù)據(jù)處理采用Spectronaut TM Pulsar；擁有質(zhì)譜儀，具備自主蛋白提取，質(zhì)譜測(cè)序等實(shí)驗(yàn)條件?！?

更正為

“針對(duì)樣本進(jìn)行相對(duì)定量（常規(guī)+全掃描），常規(guī)非靶向定量分析使用液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS/MS)技術(shù)，基于鳥(niǎo)槍法（shotgun）的數(shù)據(jù)采集方式。全掃描定量分析采用DIA（data-independent acquisition）技術(shù)(包括預(yù)實(shí)驗(yàn)評(píng)估和自建庫(kù))。質(zhì)譜性能要求如下：儀器參數(shù)：全掃描MS：**0fg 上柱量利血平的S/N為**0：1、SIM：** fg 上柱量利血平的S/N為**0：1，分辨率為**0,**0 @ m/z**0，掃描速度為** Hz；分析平臺(tái)（常規(guī)）：對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行查庫(kù)鑒定及定量分析；自行準(zhǔn)備質(zhì)譜儀，具備自主蛋白提取，質(zhì)譜測(cè)序等實(shí)驗(yàn)條件。”

9

第**項(xiàng)“土壤樣品理化性質(zhì)檢測(cè)”

服務(wù)要求由“至少檢測(cè)土壤眼皮碳、氮、磷、鉀等基礎(chǔ)理化性質(zhì)”

更正為“至少檢測(cè)土壤的碳、氮、磷、鉀等基礎(chǔ)理化性質(zhì)”

**

第**項(xiàng)“STR分型”

服務(wù)要求由“1.分子量?jī)?nèi)標(biāo)清晰、無(wú)錯(cuò)配，SQ值和PQVs值必須通過(guò)檢測(cè)。

2. 須提供原始的.fsa文件以供查詢，同時(shí)提交分型EXCEL匯總表和PDF分型圖。”

更正為

“1.對(duì)特定STR位點(diǎn)測(cè)量分析，分子量?jī)?nèi)標(biāo)清晰、無(wú)錯(cuò)配，SQ值和 PQVs值必須通過(guò)檢測(cè)。2.須提供原始的.fsa文件以供查詢，同時(shí)提交分型EXCEL匯總表和PDF分型圖。”

**

第**項(xiàng)“宏基因組建庫(kù)測(cè)序”

服務(wù)要求由“根據(jù)樣品進(jìn)行DNA提取，進(jìn)行宏基因組測(cè)序和生物信息學(xué)分析，Q** ≥**%。測(cè)序數(shù)據(jù)量（Clean data）：**G，分析內(nèi)容：樣本間基因表達(dá)水平的相關(guān)性分析、基因差異表達(dá)分析、差異表達(dá)基因的GO及KEGG富集分析、差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析、差異表達(dá)基因中的轉(zhuǎn)錄因子鑒定等。包括個(gè)性化分析?！?

更正為

“對(duì)采購(gòu)人提供的多個(gè)物種的糞便及土壤等樣本（根據(jù)野外樣本具體采集情況確定）進(jìn)行宏基因組建庫(kù)測(cè)序，包含提取、庫(kù)建、測(cè)序和分析。測(cè)序數(shù)據(jù)量（Cleandata）：**G/樣本，Q**>**%，Q**≥**%；分析內(nèi)容：Metagenome組裝、基因預(yù)測(cè)及豐度分析、物種注釋及統(tǒng)計(jì)、常用功能數(shù)據(jù)庫(kù)注釋等常規(guī)分析，以及其他根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)開(kāi)展的個(gè)性化分析。”

**

第**項(xiàng)“全基因組重測(cè)序（遺傳變異挖掘）”

服務(wù)要求由“檢測(cè)多種變異：?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性（SNP）、插入缺失（InDel）、結(jié)構(gòu)變異（SV）、拷貝數(shù)變異（CNV）等基因組信息。檢測(cè)所有的基因組區(qū)域，而不只是局限于蛋白質(zhì)編碼區(qū)域，包含基本分析和高級(jí)分析。原始數(shù)據(jù)整理，過(guò)濾和質(zhì)量評(píng)估CS-WGR-**1.SV結(jié)構(gòu)變異和注釋；基因組匹配與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)CS-WGR-**2.CNV拷貝數(shù)差異分析；SNPs檢測(cè)及注釋 Indels檢測(cè)及注釋?！?

更正為

“檢測(cè)多種變異：?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性（SNP）、插入缺失（InDel）、結(jié)構(gòu)變異（SV）、拷貝數(shù)變異（CNV）等基因組信息。檢測(cè)所有的基因組區(qū)域，而不只是局限于蛋白質(zhì)編碼區(qū)域；原始數(shù)據(jù)整理，過(guò)濾和質(zhì)量評(píng)估，結(jié)構(gòu)變異分析和注釋；基因組匹配與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、拷貝數(shù)差異分析；SNPs檢測(cè)及注釋，Indels檢測(cè)及注釋及相關(guān)高級(jí)分析。”